در مناطق خشک کشور نظیر دشت رفسنجان،‏ بهره برداری از منابع آب‌ زیرزمینی بیشتر از منابع آب‌های سطحی است. این تحقیق برای بررسی کیفیت آب‌های زیرزمینی دشت رفسنجان مدل کمی و کیفی دشت توسط مدل‌هایMODFLOW و MT?DMS تهیه شد. مدل‌های کمی و کیفی تهیه شده برای این آبخوان با داده‌های صحرایی اندازه‌گیری شده،‏ مقایسه و مدل واسنجی شد. سپس از مدل برای پیش بینی برای 2 و 5 سال آینده استفاده شد. نتایج نشان داد که میزان پارامترهای مختلف در آب زیرزمینی در کل دشت،‏ چه در گذشته و چه در آینده روند افزایشی دارد. این افزایش در حوالی شهر انار بیشتر مشاهده می‌شود. اما از میان این پارامترها،‏ کلر و شوری(EC)‎ افزایش چشمگیری در میان سایر پارامترها دارد. بنابراین کاهش برداشت،‏ کم شدن فعالیت‌های کشاورزی و افزایش تغذیه به منابع آب زیرزمینی می‌تواند تا حدودی از افزایش پارامترهای کیفی طی سال‌های آینده جلوگیری کند.