گرفتگی شیمیایی نیز مانند گرفتگی فیزیکی می‌تواند کارآیی زهکش‌ها را کاهش دهد یا موجب از کار افتادن آن‌ها شود. کربنات کلسیم ماده‌ای با حلالیت کم است که درصورت فراهم بودن شرایط،‏ سریع رسوب می‌کند و لایه‌ای سخت را تشکیل می‌دهد و موجب مسدود شدن زهکش می‌شود. با توجه به مطالعات انجام شده روی زهکش‌های نخیلات آبادان،‏ کربنات کلسیم ترکیب شیمیایی غالب رسوب یافته در بافت پوشش‌های زهکشی بود. برای بررسی رسوب‌گذاری کربنات کلسیم،‏ مطالعه‌ای آزمایشگاهی در ارتباط با رسوب‌گذاری شیمیایی این ماده روی فیلترهای ژئوتکستایل در ستون‌های آزمایشگاهی انجام شد. در بررسی‌های به عمل آمده سه نوع فیلتر ژئوتکستایل مورد آزمایش قرار گرفت. نتایج این تحقیق،‏ نشان داد که در صورت فراهم بودن شرایط،‏ رسوب کربنات کلسیم موجب کاهش آبگذری سیستم می شود. بررسی فیلتر‌های ژئوتکستایل نشان داد که در محل روزنه‌های خروجی،‏ یعنی ناحیه‌ای که شرایط هوازی- غیر‌هوازی وجود دارد،‏ بیشتر از سایر نقاط رسوبات جمع می‌شوند. تجمع رسوبات روی فیلترهای ژئوتکستایل به‌ صورت لایه‌ای اطراف الیاف را می‌گیرد و ضخامت این لایه طی زمان افزایش می‌یابد. رسوب‌گذاری شیمیایی طی آزمایش،‏ هدایت هیدرولیکی سیستم را به‌ طور متوسط 30 درصد کاهش داد. نتایج زمان گرفتگی نشان می‌دهد که با توجه به شرایط آزمایشگاهی،‏ برای دو نوع ژئوتکستایل بافته،‏ در مدت 4 و 6 سال دچار گرفتگی کامل خواهند شد.