تأمین و تخصیص حقابه‌های محیط‌زیستی رودخانه‌ها برای حفاظت از اکوسیستم منابع آب و اکوسیستم‌های وابسته باید به‌عنوان ضرورت در مدیریت پایدار منابع آب کشور در نظر گرفته شود. در این پژوهش، در یک دورة44 ساله (از 1970 تا 2013)، جریان محیط‌زیستی رودخانة بالیخلوچای بررسی شد. همچنین، با استفاده از نرم‌افزار IHA، تغییرات هیدرولوژیکی و محیط‌زیستی ناشی از احداث و بهره‌برداری از سد یامچی بررسی شد. نتایج نشان داد با استفاده از روش تنانت و برای حفاظت از رژیم جریان رودخانه در محدودةبهینه، برای تمام ماه‌های سال به جریانی در محدودة 1.96 تا 3.27 مترمکعب بر ثانیه نیاز است. روش تسمن برای حفاظت از اکوسیستم‌های رودخانه‌ای، جریانی معادل 1.31 مترمکعب بر ثانیه را تخمین زده است. روش تنانت، مقدار جریان محیط زیستی را کمتر از Q₇₅ تخمین زده است. نتایج روش منحنی تداوم جریان، نشان‌دهندةتأمین دبی 2.95 و 2.46 مترمکعب بر ثانیه به‌ترتیب برای حفاظت از رودخانه در شرایط مناسب و شرایط نسبتاً مناسب  بود. میزان تأثیر احداث سد یامچی بر پارامترهای هیدرولوژیکی به میزان 61.38 درصد با درجه تغییرات متوسط  بود. همچنین، با وجود سد یامچی، پارامترهای محیط‌زیستی به میزان 51.6 درصد تغییر یافت.